第二次世界大战前夕，一名普通的陆军士兵（龟梨和也饰）因帮助同伴而殴打长官，随后被军事法庭判处死刑。关键时刻，名叫结城（伊势谷友介饰）的神秘男子突然出现，并将之吸纳进专门培养间谍的秘密部门——D机关。历经层层考验，青年终于得到第一项任务。不久前某犹太科学家遭到暗杀，而他记载着最新式武器设计图的黑色笔记