毒枭康素差（刘青云 饰）一直带着手下张建行（郭富城 饰）从事毒品交易，新加入的成员欧志远（古天乐 饰）也因一次意外与两人有了过命交情，三人情同手足。康素差在香港的贩毒生意被警方查处后带团队逃到金三角发展，却意外发现身边藏有卧底。此刻，是敌是友，一片茫然。

1950年，广西西部十万大山地区有待解放，匪首李汉光（方辉）和妻子李月桂（胡敏英）带领一股顽匪与国民党特务勾结，将百姓骚扰得苦无宁日。根据被解放军捕获的台湾派遣副司令雷震霆提供的线索，侦察科长曾泰（于洋）假扮他的身份来到李匪内部。

抗日战争时期，年轻的女考古学家方志珍与父亲方教授同在大学任教，志珍怀着强烈的爱国心决心把失落民间的神医华佗的医著寻找回来。志珍和日本考古学家川多磨在一座古塔中发现两颗明珠，却被也来寻书的德国人干戈一伙抢走，不久，川多磨奉命回国前夕，突然被指令留下寻找华佗医书，并有浪人西协美知子和高城丈二相助。干戈利

抗美援朝期间，美帝轰炸鸭绿江大桥阴谋破产后，敌人远东情报局不甘心失败，遂派遣特务马小飞(罗泰 饰)通过列车上当乘务员的女特务王曼丽(叶琳琅 饰)接头，同本溪开药店的暗藏特务吴济春（方化 饰）勾结，指使特务徐福祥（金林 饰）颠覆我军列未遂后，又将其灭口。我铁路公安处侦察科长高健发动群众展开反特防特斗争

深秋时节，中原某城市。“茂元记”店铺火光冲天，消防车和警车呼啸而至，经足迹专家祁凡（斗兵 饰）侦察发现，会计小楚（梁玉瑾 饰）与打更人倒在血泊之中。“茂元记”党委书记肖诚（傅祖成 饰）向警方提供小楚曾遭恫吓的线索，祁凡则根据现场遗留女鞋分析出案犯腿瘸的特征。公安局收审了毒打小楚男友陈华（沈冠初 饰）

吊儿郎当的吹牛辉（周润发 饰）答应暂时照顾昔日恋人李夕（袁咏仪 饰）的儿子李阳（柯炜林 饰），代价是十万。后来发现是他亲生子且患有自闭症。从此改变了一生。当父子感情递增之际，迎来了李夕病逝消息。辉哥决定扛起做父亲的责任，带着儿子奔向人生新一页。