《最后的99天》取材于真实的历史事件，讲述了解放前夕，在距新政协预定的会期还有99天之际，上海地下党为了争取并掩护民主人士北上参加第一届新政协会议，一对同父异母的兄弟即共产党人肖昆和国民党军官肖鹏之间，展开殊死搏斗的故事。

民国初年，江州某学堂的学生苏文慧（佟丽娅饰）因家遭变故，沦为临溪首富“百德堂”的一个丫环。百德堂女主人楚念琪  楚念琪和女儿雪韵（高英饰）因身患绝症，预将百德堂传给女儿雪韵（海陆饰），她掩饰着自己的病情，还得处处提防丈夫陈天衡（赵文瑄饰）对财产的觊觎。但雪韵却因看不惯百德堂的封闭腐朽的家庭争斗，立誓