故事的地点发生在这个整年都会不可思议地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。　　梦幻的初音岛上发生了不可思议的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了，变成了勤勉努力，热衷体育的开朗青年。此

　　小维（广桥凉 配音）是一名标准的“电波少女”，表面上，她常常面无表情、一动不动，似乎无论这个世界发生了什么都跟她没有任何关系，但在内心里，有些孤独的小维还是希望能够得到他人的关心和友谊。　　一次偶然中，一位名叫银仙（小野大辅 配音）的狐仙来到了小维的身边，由于担心小维的生活和健康状态，善良的银仙

　　在距离东京南部一千公里的小宅岛上，一家豪华酒店将迎来开业一周年的庆典，届时会场将展出名贵的钻石阿缇密斯之泪。理所当然，这颗钻石吸引了怪盗基德的注意，他再次发出盗窃预告。虽然中森警部作了周密部署，却依然防不胜防，阿缇密斯之泪最终失窃。与此同时，柯南、小兰等人也受铃木园子之邀参加了酒店的周年庆典。中

　　帝丹高中即将为义演排演舞台剧，一向积极的铃木园子自告奋勇担当主演和编剧的任务。她写了一个杀人事件的剧本，准备把自己塑造成推理超强、魅力十足的女主角。故事讲述专横跋扈的新闻周刊社长大下武男独处一室的时候被人杀害，与他素有过节的职员东田直也、南泽淳平、西岐荣子和北野强成为主要嫌疑人。这本是一出悬疑刺

　　一切都由一本科幻小说引起。小说家杨匡（刘兆铭 饰）的科幻小说里描述了一种改造新人类的方法，那就是抽取人类的脑细胞，加以改造，以此甚至能控制被改造者的思想。这一切看似荒诞的想法，竟被一个阴谋控制全世界的富商看中。他出资建立了实验室，招募了一批手下，将杨匡捉了去做实验。后来，杨匡逃了出来，被人送到医

　　山田今日（坂本真绫 配音）和山田明日（金田朋子 配音）是一对感情十分要好的姐妹，虽然母亲早逝，可在父亲的关爱下，姐妹两人的生活尚且可以说是无忧无虑。可是，自从父亲背负了大笔债务人间蒸发后，美好的生活结束了，山田家陷入了水深火热之中。　　为了维持生计，今日干起了派送报纸的兼职，同时，勤劳懂事的明日

　　总有一天不论如何都要一起制作动画——上山高中动画同好会的5人向葫芦屋的甜甜圈如此起誓。她们毕业以后，分别在各自的岗位从事动画制作，并通过《第三飞行少女队》而接近了自己的梦想。　　4年后——。在动画的世界找到了自己的容身之所、逐渐成长起来的5人，开始面对新的苦恼和试炼。

　　所谓的“白箱”，是指在动画放送之前，专门制作赠送给参与了动画制作的工作人员们的录像带，其本身拥有着令人感动的悠久历史，因为这些录像带通常都被装在白色的盒子里，所以被成为“白箱”。　　一直坚守着自己理想的制作人宫森葵（木村珠莉 配音）、个性认真但有些懦弱的原画师安原绘麻（佳 村遥 配音）、怀才不遇

　　自 Arandas 联合王国（Kingdom of Arandas alliance）建国以来与 Ingelmia 诸国统合体（The Countries Unification of Ingelmia）的战事发生以来，二国一直以中间的不落要塞“Great Wall”为 分界陷入胶著的状态！在

　　目前，超级宅男土田直纯（日野聪 配音）在一所名叫花丸的幼稚园中担任老师的职务，在可爱的小朋友们的围绕下，每天都过着充满欢笑的生活。在个性单纯直率的杏（真堂圭 配音）的眼中，土田老师是世界上最最优秀的男人，她无视巨大的年龄差距，发誓漫长的余生，非他不嫁。在好友小梅（樱井真子 配音）和柊（高垣彩阳