FBI特工乔（杰弗里·迪恩·摩根 Jeffrey Dean Morgan 饰）和搭档凯瑟琳（艾比·考尼什 Abbie Cornish 饰）正在调查一宗连环杀人案，此案件手段之凶残，逻辑之混乱让两名探员感到无从下手。无奈之下，他们找到了隐居多年的通灵神探约翰（安东尼·霍普金斯 Anthony Ho

第一季的最后一集，当迈克（文特沃斯•米勒 Wentworth Miller 饰）和林肯（多米尼克•珀塞尔 Dominic Purcell 饰）他们跑到黑帮老大阿布鲁奇派来的飞机所停泊的地方时，飞行员因为安全问题而没等到他们就离开了。逃脱的囚犯们只能望天长叹，于是，他们各自展开了逃亡生涯。

美国政府发觉国家安全问题存在各种隐患。阿曼达·沃勒（维奥拉·戴维斯饰）是一个名为ARGUS的秘密政府机构的领导人，她决定召集被关押的超人类反派，用他们的自由为交换，来让他们帮助保护美国的安全。阿曼达·沃勒首先找到一个叫琼?谬恩（卡拉·迪瓦伊饰）的考古学家，后者的身体被一个名为魅巫的古老灵魂占据。后来

关押在美梦监狱的X特遣队成员获得一项可以减轻刑罚的新任务，前往南美洲的科托马耳他岛国，摧毁纳粹时期遗留的约顿海姆监狱和实验室，它当前用于关押该国的政治犯并施行人体实验。执行任务期间，X特遣队遭遇巨型外星生物海星斯塔罗，并与它发生冲突。

尼克·班尼斯特（休·杰克曼 饰）是一名私家侦探。他的工作主要是帮助客户重拾遗忘的记忆，沉湎于幽暗诱人的逝去时光。尼克生活在因海平面上升而已经半淹没的迈阿密，然而当他接手了新客户梅（丽贝卡·弗格森 饰）之后，他的生活永远改变了。一次简单的寻回失物之任务，演变成一出危机重重的惊天迷局。尼克努力寻找着梅的

两位悲痛欲绝的母亲，在儿子遭遇飞车枪杀而政府又不作为之时，选择了一条团结起来为儿报仇之路。