阿米蒂埃和琦莉耶还有她们的家人从小就过着幸福的生活，但随着厄立特里亚慢慢的毁灭，其父患上不治之病而去世。父亲的去世使得琦莉耶受很大的打击，然后琦莉耶开始讨厌其姐姐并对付她。与此同时，奈叶、菲特还有疾风正在打个计划与亚丽沙和铃音去暑假旅行。

高町奈叶（田村由香里 配音）是一位平凡的高中三年级学生，某日，在上学的路上，她同来自异世界米德其路达的尤诺（水桥香织 配音）相遇了。尤诺告诉奈叶，她正在寻找遗落人间的太古遗产“圣石之种”，这种珍贵的宝物蕴藏着巨大的能量，如果弃之不顾有可能在人间界造成巨大的破坏，接二连三的波折之后，奈叶成为了帮助尤诺