故事发生在遥远的未来，彼时，大陆板块的活动令海水渐渐淹没了日本的大部分国土，人们不得不在海上建造起新的都市。随着时间的推移，海上都市的规模越来越大，航路越来越复杂，为了维持秩序，一种人们称之为“蓝色人鱼”的新型职业渐渐被大众所接收和憧憬，这份光荣的职业亦成为了很多女子高中生们未来奋斗的目标。　　

　　即将升上初中二年级的朝日奈未来，在春假的某天晚上，看到一神秘物体从天落入附近的公园里。“难道是魔法使？”，兴奋的未来第二天一早就和自小就喜爱着的绒毛玩具熊“毛芙伦”一起向公园前进。结果在那里看到的是……骑着扫帚漂浮在空中的女孩……自称是理子的那个女孩子，竟然是魔法使。　　未来对魔法使非常感兴趣，

　　故事发生在遥远的未来，彼时，大陆板块的活动令海水渐渐淹没了日本的大部分国土，人们不得不在海上建造起新的都市。随着时间的推移，海上都市的规模越来越大，航路越来越复杂，为了维持秩序，一种人们称之为“蓝色人鱼”的新型职业渐渐被大众所接收和憧憬，这份光荣的职业亦成为了很多女子高中生们未来奋斗的目标。

生于大海，守护大海，去往大海——那就是蓝色人鱼！憧憬着守护海洋安全的职业“蓝色人鱼”进入横须贺女子海洋学校的岬明乃，被任命为航洋舰“晴风”的舰长，和同班的成员一同参加海洋实习。本应是驱动舰船前往目的地的安全航海，但等待着她们的却是接连不断的危机。来自教员舰突然的发炮、与失控的其他学生舰的战斗、救难船